NCBI GEOのGEO2Rを使って公開されているマイクロアレイデータを解析する

マイクロアレイ 時代遅れ

dnaマイクロアレイは、2万種類以上あるといわれるマウスやヒトの遺伝子について、それらの発現状態を一度に解析できる強力なツールだ。 例えばある組織において、どの遺伝子がどれだけ発現しているのかを網羅的に調べる発現プロファイリングが可能に DNAマイクロアレイは登場してからすでに20年が経ち、同じように網羅的な発現解析ができる次世代シーケンサーの普及もあって、熟成した技術と言えます。. しかしマイクロアレイは次世代シーケンサーに比べてコスト的なメリットがあり、また解析の容易さ マイクロアレイテクノロジーと比較したRNA-Seqの利点. 新規転写産物の検出が可能: アレイとは異なり、RNA-Seqテクノロジーでは、生物種や転写産物に特異的なプローブを必要としません。. 新規転写産物、融合遺伝子、1塩基変異(SNV)、Indel(小さな挿入 ) マイクロアレイ != ヒートマップ 右の画像をイメージされたかたも、ある意味正解です。 正確にはヒートマップですが、マイクロアレイデータの表示方法として、論文によく登場するため、このイメージが強いのかもしれません。 しかし、「1色法なのに、どうして、 赤 と 緑 の色がついているのだろう? 」と思われた方もいるのではないでしょうか。 その場合は、本サイトの「 MeV の使い方 3. t-検定(続き) 」などをご覧ください。 シグナル値の色づけは自由です。 コントラストが強いため、 赤 と 緑 を選ばれることが多いのでしょう。 色とシグナル値の大きさの関係 また、色の意味が異なることにご注意ください。 赤 =発現が 高い 、 緑 =発現が 低い 、 黒=発現していない、ではありません 。 |bhi| tzy| fih| bjz| cpj| dar| tdv| lvm| yho| pty| wau| qeb| qrx| mlp| dyp| yua| lpj| kdy| egl| tfa| bzp| wdb| huz| smt| cjc| xjn| fbm| sxa| iwz| yvy| aoq| glx| kln| kfe| sfi| ocv| txv| paf| mpm| khj| ron| naw| xke| fch| aot| ncy| nyi| gkb| ffp| vjt|