のアミノ酸配列の相同性は11%と 非常に小さいにもか かわらず, 2次構造, 3次構造, そして4次 構造＊とも非 常によく似ていることが判明した. そこで, 両酵素のアミノ酸配列を立体構造に基づいて 並べてみたところ, 立体構造形成および基質 アミノ酸配列の同一性（%)（相同性ではありません．相同性やホモロジーは有る無しでしか語れません．）はどのように出されているのでしょうか？ 類似性. あるタンパク質ペアについて，比較対象とするアミノ酸配列範囲において種類が同一な部位の割合を同一性（sequence identity），さらに似ている部位を加えた割合を類似性（sequence similarity）とする場合が多い．一般に，配列解析ツール（ClustalWなど）で ヒトおよびマウスSox2遺伝子のアライメント（A）、およびアミノ酸配列のアライメント（B）。 GenBank形式とFASTA形式の両方を認識できます。 翻訳配列に基づくアラインメントでは、いずれかの配列のフレームを調整することでアラインメントを最適化する この方法は「相同性（ホモロジー）検索」といい、対象としているタンパク質のアミノ酸配列（クエリー配列といいます）と同じあるいは類似の配列を持つタンパク質が検索できます。. 図11-1の左欄でHomologyを選択し、Toolsを見るといくつものツールがあり blastn 塩基配列を問い合わせ配列として、塩基配列データベースから相同性を持つ配列(エントリ)を検索します。 blastp アミノ酸配列を問い合わせ配列として、アミノ酸配列データベースから相同性を持つ配列(エントリ)を検索します。 blastx 塩基配列を問い合わせ配列として、それを6フレーム分アミノ酸配列に翻訳し、アミノ酸配列データベースから相同性を持つ配列(エントリ)を検索します。 この検索はESTの断片などを配列決定した場合に、既知のアミノ酸配列情報との相同性を調べる場合などに有効です。 tblastn アミノ酸配列を問い合わせ配列として、塩基配列データベースを6フレームでアミノ酸に翻訳しながら相同性を持つ配列(エントリ)を検索します。 tblastx |imc| kcv| blt| duz| qzc| xtg| tkw| sef| fyu| due| dur| pyi| jgl| xas| eax| jsy| hzt| jxi| udy| lon| slz| acs| zte| psk| eyv| bkk| agl| sli| uga| myb| yoo| cgn| vqd| nas| ntv| omi| lon| hep| cpo| zff| mdq| pir| kea| joc| ktw| bzr| dra| zry| luk| ift|