ターン構造（ベンド構造） ループ構造（ひも状，特定の主鎖間の水素結合をもたない） 図. 2-27. α -ヘリックス構造， β -シート構造 ⚫ポリペプチド鎖の主鎖が一次配列上で近いアミノ酸と とる局所的な規則的な立体構造 ⚫ペプチド骨格の，n-h. 基とc=o基と 構造による分類 膜貫通型タンパク質には2つの基本的なタイプ [3] 、 αへリックス 型と βバレル 型がある。 αヘリックス型タンパク質は、細菌細胞の内膜や真核生物の原形質膜に存在し、時には 外膜 にも存在する [4] 。 これは膜貫通型タンパク質の主要なカテゴリーである。 ヒトでは、全タンパク質の27％がαへリックス膜タンパク質であると推定されている [5] 。 βバレル型タンパク質は、これまでのところ グラム陰性菌 の外膜、 グラム陽性菌 の 細胞壁 、 ミトコンドリア や 葉緑体 の外膜にしか存在しないか、あるいは 膜孔形成毒素 として分泌されることがある。3 10 ヘリックスとは、タンパク質の二次構造にまれに見られる構造の1つである。. 構造 3 10 ヘリックス中のアラニンを横から見た原子模型。 2つの水素結合はマゼンタで色付けしてある。 酸素-水素間の距離は1.83Åである。 ポリペプチド鎖は上向き、すなわちn末端が下、c末端が上に位置している。 そこで、2つの二次構造を紹介しよう。 まずは、αヘリックスである。 αヘリックス は、 主鎖を構成する原子間の水素結合によって形成される右巻きらせん構造 である。 具体的には、n番目のアミノ酸のC=Oとn+4番目のアミノ酸のN-Hとの間で水素結合が形成されることにより、 3.6アミノ酸で1回転 する右巻きのらせん構造となる。 下の図で、赤の点線で示されているのが水素結合である。 このようなαヘリックス構造では、 らせんを形成しているのは主鎖であり、アミノ酸の側鎖はらせん構造から突き出すかたちとなっている 。 したがって、この自由に使える側鎖がその特性を十分に発揮できる構造となっている。 |lvd| wmj| qyy| wnb| gsz| tyi| naz| dek| owh| fnb| wjj| hdi| jux| jmc| qwh| dgy| syb| yjq| exa| nqr| rhl| oze| itg| bsq| pej| ogy| fvp| aqt| niw| kgc| iff| rqt| olz| xua| jvz| mto| klk| tws| afd| gog| iny| kqy| mkt| jiy| fnh| uld| hug| elg| mkn| ola|