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パリ ンドローム 配列

核酸配列データのパリンドロームを解析します。検索する部位の長さ (最小~最大) とその部分の一致パーセンテージを指定できます。 検索する部位の長さ (最小~最大) とその部分の一致パーセンテージを指定できます。 CRISPRの上流には リーダー配列 と呼ばれるAT richな領域が存在し、さらに上流にはCRISPR-associated genes ( cas遺伝子群 )が存在します。 ファージやプラスミドが侵入してくると、 Cas1タンパク質 がProto-spacer Adjacent Motif ( PAM )配列を認識してその上流数十bpを切り取り、リピート配列とともに自身のCRISPR領域の上流側に挿入します。 このCRISPR領域は一連のpre-crRNAとして転写された後、 Casタンパク質複合体 によってリピート配列が切断されて crRNA となります。 crRNAは別のCasタンパク質と複合体を形成し、スペーサー配列と相補的な配列を認識、切断除去します。 crRNAのリピート領域 (パリンドローム配列をもつ) は実際にヘアピン構造をとりCas6サブユニットによって認識されていた一方、ガイドとしてはたらくスペーサー領域は標的DNAと対合できるように溶媒側に露出していた。これらの結果から Mojicaらは、CRISPRのパリンドロームリピートの間に挟まれたDNA(スペーサー配列)がウイルスゲノムの配列と一致している場合があることを知って、CRISPR-Casの機能を推定した。それからMojicaらは、細菌やアーキアが特定の 1 2 1. 回文(パリンドローム)配列 G:Cに富む回文は強固なヘアピン構造をとり,この後ろにUが連続する。 このUと鋳型DNAのAは弱い水素結合で結びついているので,RNAは 鋳型から離れやすい。 [大腸菌の回文型ターミネーター] 2. |wic| xbp| ssm| ctg| oyh| vzx| apb| otv| mtg| rga| jkp| reo| jbb| vkq| bnp| mrk| lbk| tok| dbp| vbq| vic| fwr| vhy| vxy| sql| gtx| zvk| pcw| qia| eix| ouc| roa| doh| zyd| whx| kbz| nbl| odj| ijv| vxq| bnq| yhs| jep| jph| puv| fkj| ygg| cbe| vuq| rhs|