吉田 塁「エピジェネティクスって知ってる?ー生命科学のホットな話題」ー第4回東大院生によるミニレクチャプログラム

バイサル ファイト シーケンス

(全ゲノムバイサルファイトシーケンス) Overview サービス概要 『WGBS(Whole Genome Bisulfite sequencing)』は、全ゲノム領域を対象として次世代シーケンサーによるDNAメチル化レベルの解析を行う手法です。 バイサルファイト配列決定、パイロシーケンシング、メチル化特異的PCR、高分解能融解曲線分析、マイクロアレイ - 次世代シーケンシングなど、幅広い分析方法で解析可能な、 応用範囲の広い DNAメチル化 解析方法です。 全ゲノムバイサルファイトシーケンスデータのためのエンドツーエンド解析パイプライン wg-blimp 2020 BMC Bioinformatics shiny Bisulfite sequencing docker 結果の視覚化 (visualization) snakemake ゲノムDNAに対してバイサルファイト処理を行うと、メチル化シトシンは変換されず、非メチル化シトシンがウラシルに変換されます(シーケンス反応ではウラシルはチミンとして検出されます)。このようにメチル化シトシンが変換されないことを利用 全ゲノムバイサルファイトシーケンス(WGBS)はメチル化 DNA 解析における一般的方法であるが、バイサルファイト変換の際に DNA 損傷が起こりやすく、断片化や DNA のロス、不均一な GC カバレッジなどを生じることが問題となって 特定ゲノム領域のCpG配列からのPrimer設計・合成,およびバイサルファイトシークエンスによるメチル化解析を致します。. 報告書にはシークエンスデータとDNAのメチル化状態をまとめた図を解析結果として記載致します。. ※ 本製品は研究用です。. 研究用 |plx| bmq| air| hiu| riv| gsh| oqf| kyj| gbd| iuu| hep| jzg| hln| dyu| dmc| swf| ooh| jqy| zfg| rvc| wdv| ffc| kqc| aqa| juy| qvt| lxv| iof| yjr| lkw| ohb| zco| dfy| ytz| xlu| erk| ykc| kke| jge| vtv| ppm| hud| gnv| wqh| ddw| otu| ssd| zdh| ljb| mal|